為站在高職教育的制高點，吉安市政府于2014年4月1日與深圳職業技術學院簽訂深度合作辦學協議，開創了高職院校“跨區合作、優資共享”“特區帶老區、名校助普校”新模式。深圳職院選派管理團隊和專家隊伍，全面開放各類資源，支援吉安職院高質量跨越式發展。
學校內設機械與電子工程學院、現代農林工程學院、建筑與環境工程學院、經濟與管理學院、旅游學院、醫護學院、師范學院、馬克思主義學院、創新創業學院、藝術學院等10個二級學院，下轄吉安師范學校、井岡山應用科技學校、吉安市高級技工學校、吉安文藝學校等4所中職學校。現有在編教師645名，其中高級職稱173名，碩士以上427名，雙師型教師占41%；并聘請企業高管、技術骨干、能工巧匠等兼職教師130余名。已建成校內外實驗、實訓中心430個，擁有實訓教學設備價值達1.18億元，圖書資料近93萬冊，建有數字化圖書館管理系統，正穩妥推進以大數據為中心的智慧型校園建設。
學校秉承“崇文明理、厚德精技”的校訓，以立德樹人為根本任務，以“工匠精神”為內涵，加快辦學水平提升。與深圳職院深入開展專業建設合作，加強雙師素質教師、“雙師型”教師的培養，大力推進教學改革，突出強化實驗、實訓、專業綜合能力實踐等環節，加強課程建設。緊密對接經濟社會發展需求，突出“校企合作、產教融合”等先進理念，探索創新現代學徒制、校企雙主體協同育人等職教人才培養模式。深化校企合作，校企共建校內外實訓基地、獨立學院和特色專業，在人才培養、技能培訓、技術科研等方面，實現互惠雙贏。學校現有社團68個，注冊志愿者5788人。“三全育人”工程深入實施，從課堂時空、校園時空、社會時空全方位培養學生的格局已經形成。
辦學五年來，吉安職業技術學院辦學發展迅速，正努力向“省內一流、全國知名”高職院校的目標穩步邁進。科研項目市廳級以上立項256項，其中省部級以上94項；發表論文537篇，擁有專利45項。省社科規劃、文化藝術規劃、教育科學規劃項目共立項30項，其中2018年社科規劃項目立項數在全省高職院校中排名第一，2019年文化藝術規劃、教育科學規劃項目立項數在全省高職院校分別排名第一、第三。師生獲得省級以上獎項336項，其中國家級獎項62項。2018年組織學生參加全國職業院校技能大賽3項，獲得1個一等獎、2個三等獎，其中“嵌入式技術應用開發”賽項獲團體一等獎，實現了江西省職業院校在該賽項全國一等獎零的突破。2017年，學校順利通過江西省高等學校創新創業教育專項督導評估。學校創編的情境舞劇《十送紅軍》在第七屆全國職業院校“文化育人”高端論壇上大放異彩，受邀參加教育部、文化部等多部門聯合主辦的2018年全國職業院校技能大賽中華優秀傳統文化藝術表演賽獲一等獎；與兄弟院校聯合創編的舞劇《井岡·井岡》榮獲2018年中國舞蹈最高獎“荷花獎”，并作為經典節目在江西省高雅藝術進校園巡演。2016年，學校成功舉辦第六屆全國職業院校“文化育人”高端論壇；2019年，學校成功承辦首屆全國職業院校紅色文化研究與推廣高端論壇，并被推選為全國職業院校紅色文化研究與教育聯盟理事長單位。
